当前社会中针对医院污水处理所应用最多的方案主要有两种：第一种CASS工艺也就是人们常说周期性循环活性污泥法，这是一种基于SBR法所进行更新和改进的一种全新方法，CASS工艺法主要是通过CASS反应器所达到对医院污水进行治理的作用，反应器主要包括三个方面，生物选择区、缺氧区和最为重要也是产生反应最为明显的好氧区，

在设计CASS反应器时一定要对三个区域所占的比例进行详细的测量，要严格的按照1∶2∶17的比例进行制作，只有比例正确才能够充分的发挥CASS反应器的作用，避免因为比例不恰当所引起的一系列问题。在CASS反应器中生物选择区最为主要的作用其实就是将医院污水和污泥进行容纳，同时，活性污泥在通过好氧区之后回流在生物选择区内与全新的污水进行充分的混合和接触，营造出一个微生物相互竞争的局面，让微生物相互进行厮杀，挑选出一些较为强势的优秀菌种，对丝状菌的繁殖进行一定程度的抑制，使得系统能够具备更为稳定的效果，防止系统在工作过程中出现问题，同时，活性污泥自身所具备的独有特点，也能够有效的帮助系统对溶解性基质进行去除，提高去除效率，加快工作进度，并且在对一些难以进行降解的有机物进行分解时也能够起到一个良好的作用，对于污泥中所存在的磷元素也能够进行有效的释放，但一定要保证是在厌氧的条件下才能够进行，否则无法对磷元素进行释放。缺氧区最为主要的作用就是辅助生物选择区进行工作，缓解由于污水排放所带来的水质和水量的变化，为生物选择区的工作起到一个缓冲的作用，该区能够在生物选择区的基础上对磷元素进行进一步的释放，并且可以通过再生污泥对有机物再次进行去除，这种去除方法具有极为强烈的作用，可以将污水中的有机物去除80%，可以说是当前社会中去除污水有机物最为有效的方法。好氧区则主要是通过微生物对有机物进行分解的场所，主要可以分为四个阶段，在四个阶段的过程中还可以根据实际情况的不同进行一定程度的调整，使得该方法能够有效的对污水进行治理。

第二种方法则是二氧化氯消毒法。二氧化氯作为一种经过世界性认证的具有高强度消毒作用的一种杀菌剂，在治理医院污水方面也必然有着极为显著的作用，是对传统的氯系列消毒剂最好的替代品和升级版本，能够超过氯杀毒效果的5倍，可谓是一个极为惊人的数据，并且在杀毒完毕以后不会留有大量的氯对人们的健康产生危害，有效的避免了氯超标现象的出现。同时，二氧化氯最大优点还是在于能够在消毒的过程中所产生的化学反应相对来说不会出现一些极为有害的物质，不会生成三卤甲烷这种具有极高致癌性的物质，并且还会对这些物质的出现进行一定程度的抑制，能够有效的保障污水处理中工作人员的身体健康，将有可能出现的危害降到最低。虽然二氧化氯有着较为显著的积极作用，但是也存在着一定的问题，主要是因为二氧化氯的稳定性较差，在使用的过程中需要通过现场制备才能够有效的应用，极大的限制了二氧化氯的应用范围，并且二氧化氯在使用电解法发生器进行应用时，还会出现效率过低的现象，对设备也有着极为强烈的腐蚀，所以二氧化氯的应用并没有得到一个有效的普及。